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Die Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung (SGN) wurde 1817 gegründet und zählt zu den wichtigsten Forschungseinrichtungen rund um die biologische Vielfalt. An den 12 Standorten in ganz Deutschland betreiben Wissenschaftler*innen aus über 40 Nationen modernste Forschung auf internationaler Ebene. Am Standort in der sächsischen Landeshauptstadt Dresden befinden sich die Senckenberg Naturhistorischen Sammlungen in einer historisch geprägten Stadt mit einem großen kulturellen Angebot und exzellenten Forschungskooperationen.
Die Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung mit Sitz in Frankfurt am Main sucht für das Institut „Senckenberg Naturhistorische Sammlungen Dresden“ (SNSD) in Dresden zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine*n
Bioinformatiker*in (m/w/d)
(angewandte Bioinformatik)
(Vollzeit 100 %, vollzeitnahe Tätigkeit möglich)
Ihre Aufgaben
- Assemblierung von NGS-Short-Read-Daten (referenzbasierte Assemblierung), Calling und Filterung von Varianten, Bewertung von Variantenqualität und Informationsgehalt
- Phylogenetische und phylogeographische Analysen von NGS Daten
- Erkennung von Selektion, besonders in Genotyp-Phänotyp-Wechselwirkungen der Flügelmuster von Faltern
- Analyse von Varianten im Hinblick auf Signale für Introgression und Hybridisierung mit Fokus auf Daten historischer DNA
- Anpassung der analytischen Methoden auf NGS-short read Daten historischer DNA-Proben, Bewertung von individueller Qualität und Informationsgehalt in Bezug auf das Probenalter
- Publikation der Ergebnisse in geeigneten Fachzeitschriften
Ihr Profil
- Abgeschlossenes Studium inkl. Promotion in Biologie, Bioinformatik oder einer vergleichbaren Fachrichtung
- International anerkannte Forschungserfahrung und Publikationen in namhaften Fachzeitschriften
- Erfahrung mit der Verarbeitung von Short-Read-Daten im Hochdurchsatz einschließlich Qualitätskontrolle und referenzbasiertem Alignment
- Erfahrung bei den Schritten Variant Calling, Filterung, Analyse
- Erfahrung im Umgang mit genetischen Daten von wissenschaftlichem Sammlungsmaterial
- Erfahrung mit Datenmanagement (inkl. Backup-Plan)
- Sachkenntnis bei der Veröffentlichung von Daten in öffentlichen Sequenzarchiven
- Hervorragende sprachliche Ausdrucksfähigkeit in Englisch (mündlich und schriftlich)
- Teamgeist, Verantwortungsbewusstsein und Motivation sowie Eigeninitiative
Zusätzlich wünschenswerte Erfahrungen und Kenntnisse
- HPC-Auftragseinreichung/Modulverwendung
- Nachweis von Hybridisierung
- Anwendung und Anpassung analytischer Pipelines für NGS-Daten historischer DNA
- Vergleich von Variantendatensätzen unterschiedlicher Erfassungsalter (Zeitscheibenvergleich)
- Phänotyp-Genotyp-Analysen, z. B. GWAS
- Deutschkenntnisse
Wir bieten Ihnen
- Ausgezeichnete Arbeitsbedingungen, eine attraktive, verantwortungsvolle und herausfordernde Tätigkeit im inspirierenden Forschungsumfeld einer weltweit anerkannten Forschungseinrichtung mit motiviert und professionell arbeitenden Kolleg*innen
- Ein offenes und kollegiales Umfeld mit flexiblen Arbeitszeiten, mobilem Arbeiten, familienfreundlichen Arbeitsbedingungen, Unterstützung bei der Kinderbetreuung oder bei der Pflege von Familienangehörigen (zertifiziert durch das „audit berufundfamilie“)
- Tarifliche Jahressonderzahlung, tariflichen Urlaubsanspruch
- Dienstausweis in Verbindung mit kostenfreiem Eintritt in die Senckenberg-Museen
- Leben in der pulsierenden Stadt Dresden (560.000 Einwohner), einem bedeutenden europäischen Zentrum für Musik, Kunst und Wissenschaft.
Ort: Dresden
Beschäftigungsumfang: Vollzeit (100 %), vollzeitnahe Teilzeit möglich
Vertragsart: Projektbefristet für 18 Monate
Vergütung: TV-L E13
Senckenberg engagiert sich für Vielfalt. Wir profitieren von den unterschiedlichen Fachkenntnissen, Perspektiven und Persönlichkeiten unserer Mitarbeiter*innen und freuen uns über jede Bewerbung qualifizierter Kandidat*innen, unabhängig von Alter, Geschlecht oder geschlechtlicher Identität, ethnischer oder kultureller Herkunft, Religion und Weltanschauung, sexueller Orientierung und Identität oder Behinderung. Bewerber*innen mit einer Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung besonders berücksichtigt. Senckenberg unterstützt aktiv die Vereinbarkeit von Beruf und Familie und legt großen Wert auf eine gleichberechtigte und inklusive Kultur der Zusammenarbeit.
Sie möchten sich bewerben?
Dann senden Sie Ihre vollständigen und aussagekräftigen Bewerbungsunterlagen (Motivationsschreiben mit kurzer Beschreibung der bereits abgeschlossenen und aktuellen Forschung, Lebenslauf, akademische Zeugnisse, Publikationsliste und, falls vorhanden, Empfehlungsschreiben) in elektronischer Form (als eine zusammenhängende PDF-Datei) unter Angabe der Referenznummer „#07-25001 Bioinformatiker*in (m/w/d)“ bis zum 20.02.2025 an recruiting@senckenberg.de oder bewerben Sie sich online über das Bewerbungsformular auf unserer Webseite unter Online bewerben | Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung.
Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung
Senckenberganlage 25
60325 Frankfurt a.M.
E-Mail: recruiting@senckenberg.de
Für fachliche Rückfragen zur Stelle steht Ihnen Frau Dr. Anna Hundsdörfer unter der E-Mail-Adresse anna.hundsdoerfer@senckenberg.de sehr gerne zur Verfügung.
Weitere Informationen über die Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung finden Sie unter www.senckenberg.de.
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Founded in 1817, the Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung (SGN) is one of the most important research institutions in the area of biological diversity. At our twelve sites in Germany, scientists from over 40 nations conduct cutting-edge research on an international level. Located in Saxony’s capital, the Senckenberg Natural History Collections provide excellent research collaborations in the historic city of Dresden.
For its Senckenberg Natural History Collections Dresden, the Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung with headquarters in Frankfurt (Main) is seeking to fill the position of a
bioinformatician (m/f/d)
(applied bioinformatics)
(full time / part-time options available)
as soon as possible.
Your tasks
- Assembly of NGS short read data (reference based), calling and filtering of variants, quality assessment of variants and informativeness
- Phylogenetic and phylogeographic analyses of NGS data sets
- Detect selection, especially in genotype-phenotype-interactions related to wing patterns of moths.
- Analysis of variants to detect signals of introgression and hybridisation with a focus on data from historic DNA
- Readiness to adapt analytical methodology to NGS-short read data from historic DNA, testing of sample quality and informativeness with respect to sample age
- Publication of results in high profile scientific journals
Your profile
- PhD in biology, bioinformatics or a related discipline
- Internationally recognized research and publications
- Experience in handling high-throughput short-read data incl. quality control and reference-based alignment
- Experience in variant calling, filtering, analyses
- Experience in handling genetic data from scientific collection material
- Professional in data management (incl. backup plan)
- Practical knowledge of NGS data deposition in public databases
- Excellent team worker
- Excellent communication skills in English (spoken and written)
- Highly motivated, keen to take the initiative and to contribute, and with a strong sense of responsibility
Experience in the following areas is desirable
- HPC job submission/module handling
- Hybridization inference
- Use and expansion of analytical pipelines for NGS data for historic DNA
- Comparison of variant data sets of samples of different ages (time slices)
- Genotype-phenotype correlations such as GWAS
- German language skills
We offer
- Excellent working conditions in the inspiring environment of a globally recognized research institution
- Flexible working hours, mobile working options, support with childcare or caring for family members (certified by „audit berufundfamilie“), open and cooperative atmosphere
- Special annual payment, 30 days leave p.a.
- Free entry to numerous museums
- Life in the vibrant city of Dresden, a major European culture and science hub
Location: Dresden
Working hours: Fulltime, part time options available
Position: Project-based for 18 months
Salary: E 13 according to collective bargaining agreement of the German Länder (TV-L)
Senckenberg is committed to diversity. We benefit from the different expertise, perspectives and personalities of our staff and welcome every application from qualified candidates, irrespective of age, gender, ethnic or cultural origin, religion and ideology, sexual orientation and identity or disability. Applicants with a severe disability will be given special consideration in case of equal suitability. Senckenberg actively supports the compatibility of work and family and places great emphasis on an equal and inclusive work culture. The legal regulations regarding part-time work are met.
How to apply?
Please send your complete and comprehensive application (letter of motivation with a short description of your previous and current research foci, a CV, certificates of academic achievements, list of publications as well as letter(s) of recommendation, if available) electronically (as a single PDF) to recruiting@senckenberg.de stating the reference “#07-25001- bioinformatician m/f/d” by February 20, 2025 or apply online, using the application form on our website www.senckenberg.de/de/karriere/bewerbung/
Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung
Senckenberganlage 25
60325 Frankfurt a.M.
E-Mail: recruiting@senckenberg.de
If you have any specific questions about the position, please contact Dr. Anna Hundsdörfer at anna.hundsdoerfer@senckenberg.de
Please visit our website at www.senckenberg.de for further information about the Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung.
Achtung! Bitte senden Sie Ihre Bewerbungen direkt an die Einrichtung, die
die
Stelle ausschreibt, und nicht an den Deutschen Museumsbund.
Vielen Dank!